Kontrola se zaměřila mimo jiné na hospodaření s příjmy z veřejného zdravotního pojištění, na části účetní závěrky, jako jsou výkaz zisku a ztráty (zkráceně výsledkovka) a rozvaha, na daňové přiznání a také na vybrané okruhy související s reklamní a propagační činností VZP.

Finanční úřad po podrobném prostudování tisíců stran podkladů nevytkl Všeobecné zdravotní pojišťovně ani jediné pochybení. U instituce, která má více než tři tisíce zaměstnanců a hospodaří ročně s rozpočtem kolem 150 miliard korun, jde o vynikající výsledek.

Jedním z podnětů, které finanční úředníky do VZP přivedly, byly i výsledky kontroly, kterou ve VZP provedlo v roce 2012 ministerstvo zdravotnictví. To tehdy vyslovilo mimo jiné i pochyby, zda VZP neporušuje zákon č. 586/1992 Sb., o daních z příjmů. Důsledná kontrola finančního úřadu to však teď vyvrátila.

V poslední době jde o několikátou prověrku ze strany státní správy, která pro VZP dopadla na jedničku. Antimonopolní úřad se například zabýval podnětem, zda VZP neporušila zákon při veřejné zakázce na pobyt nemocných dětí u Egejského moře v rámci projektu Mořský koník. I v tomto případě však úřad v polovině září rozhodl, že postup VZP byl zcela v souladu s platnými předpisy.