Sídlem krajské pobočky s působností pro vyšší územní samosprávné celky Plzeňský a Karlovarský kraj je Plzeň, Sady 5. května 59. Krajská pobočka je tvořena územními pracovišti Plzeň, Klatovy, Domažlice, Tachov, Karlovy Vary, Cheb, Sokolov a 13 úřadovnami. VZP se v těchto krajích aktuálně stará o téměř 560 tisíc pojištěnců. Zdravotní péče je pro pojištěnce VZP smluvně zajištěna ve více než 2 200 zdravotnických zařízeních.
V Plzeňském kraji má VZP uzavřeno téměř 1450 smluv se zdravotnickými zařízeními, z toho pak 355 smluv s praktickými lékaři, 420 s ambulantními specialisty, 334 se stomatology. Smluvně jsou také zajištěny všechny nemocnice a léčebny dlouhodobě nemocných.
V Karlovarském kraji má VZP smluvně zajištěno téměř 800 zdravotnických zařízení, z toho 188 praktických lékařů, 277 ambulantních specialistů a 149 stomatologů. Dále jsou uzavřeny smlouvy se všemi nemocnicemi v kraji a s devíti léčebnami dlouhodobě nemocných.
